高中生侦探工藤新一有一个号称世界推理小说家的爸爸。每天都能解决许多疑难案件的他，有一天，在与青梅竹马的毛利兰约会的途中，目击了神秘的黑衣男子们非法交易的瞬间！为了灭口，新一被灌下了毒药。虽然没有生命危险，但他的身体却变成了孩子的样子！？随后，他取了江户川柯南这个假名，继续踏上了解决疑难案件的道路。这全是为了解开神秘黑衣组织的真正面目，并变回工藤新一原来的样子。这个世界上没什么解不开的迷案！从不误入迷宫的名侦探，真相只有一个！！

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